Open Science Week 2024 : l’Université Paris-Saclay s’engage pour la science ouverte !

Cette année, du 4 au 8 novembre 2024, l’événement devient l’Open Science Week et se fera principalement en ligne. L’occasion de revenir sur les bonnes pratiques et les défis disciplinaires dans les domaines tels que les sciences humaines et sociales, géosciences/environnement, les sciences du vivant, la santé…

Programme

Lundi 4 novembre (Sciences humaines et sociales)
10h-11h, Nathalie Delame, Projet Agrilogue : un catalogue de données sur l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (Français)

Pour aider les économistes de l’INRAE à accéder aux données les plus couramment utilisées dans leurs travaux, un outil a été mis en ligne sur internet : Agrilogue. L’exposé propose une présentation du contenu actuel et des développements en cours et à venir.

11h30 à 12h30, Sébastien Oliveau et Margaux NGUYEN NGOC MINH, l’ouverture des données en SHS : un écosystème bien organisé pour accompagner les chercheurs (Français)

14h-15h, Célian Godefroid, Publications scientifiques et données de la recherche en SHS : aspects juridiques (Français)

Ce webinaire va présenter ce que la loi permet aux chercheuses et chercheurs de faire en termes de publications scientifiques et de gestion des données de la recherche, avec un point sur le cadre légal autour de la science ouverte, son évolution, sa mise en place, et sa pertinence pour les SHS.

Mardi 5 novembre (Sciences et techniques)
10h-11h, Sylvain Chevallier, Open science tools for reproducibility (English)

11h30-12h30, Julien Chiquet, Projet revue Computo

14h-15h, F. Massimo, Smilei: « ecosystem and perspectives of a collaborative, multi-purpose Particle in Cell code » (English)

Smilei is a collaborative, open-source Particle-in-Cell (PIC) simulation code, recognized in plasma physics for its diverse range of applications, including high intensity laser-matter interaction, astrophysics, fusion and plasma acceleration, as well as for its user-friendly interface.

The talk will trace the history of the code, describing its main developments by a team of experts in laser-plasma interaction and high-performance computing. It will highlight the evolution of its thriving community, which has gradually expanded to the international level, allowing the code to become a platform for physics research, advancements in parallel computing techniques, and educational programs in plasma physics at universities.

The talk will also address examples of challenges underlying the development of an open-source, high-performance, user-oriented simulation code and discuss the future perspectives of Smilei in its ecosystem.

16h-17h, J. Peloton, FINK-Logiciel Libre : « Explorer l’univers ensemble : La science ouverte et son rôle dans la recherche en astronomie » (Français)

Mercredi 6 novembre (multidisciplinaire)
10h-11h30, table ronde animé par Arnaud Boutin, en présentiel (retransmis en simultanée par visioconférence) : « Approche multidisciplinaire de la Science Ouverte en sciences du sport et du mouvement humain » (Français)

Lieu : Salle des actes au bâtiment 335, Faculté des Sciences du Sport – Université Paris-Saclay, Rue Pierre de Coubertin, 91440, Bures-sur-Yvette.

Cette table ronde réunira des enseignant.e.s-chercheur.euse.s de divers domaines scientifiques (neurosciences, management, sciences sociales…) pour aborder les enjeux et défis liés à la science ouverte dans la recherche en sciences du sport et du mouvement humain.

La liste des intervenants :

Claire Thomas-Junius (Professeure, Université d’Evry)
Matthieu Guemann (Maître de Conférences, Université d’Orléans)
Bastien Berret (Professeur, Université Paris-Saclay)
Christophe Granger (Maître de Conférences, Université Paris-Saclay)
Antoine Feuillet (Maître de Conférences, Université Paris-Saclay)
Arnaud Boutin (Maître de Conférences, Université Paris-Saclay) – En charge de l’animation.
14h-15h, Liliana Ibanescu, projet DataSusFood, (Français)

15h30-16h30, Thomas Guillemaud, Présentation Revue PCI (Peer Community in), (Français)

Jeudi 7 novembre (Gésociences/environnement, sciences du vivant)
9h30-10h30, Zelia Dionnet, Projet SSHADE (Solid Spectroscopy Hosting Architecture of Databases and Expertise) (English)

In this presentation, I will introduce SSHADE, a database infrastructure dedicated to solid state spectroscopy for materials of astrophysical interest. SSHADE provides a vast collection of spectral data (from gamma rays to radio waves) on materials such as ices, minerals, rocks, organic compounds, and even liquids. These samples come from laboratory syntheses, natural terrestrial analogues, or extraterrestrial sources, including meteorites and lunar soils.

11h-12h, Frederic Schmidt, Projet PDSSP (Pole des Surfaces Planétaire) (Français)

Le Pôle de Données et Services Surface Planétaire PDSSP est une nouvelle structure entre le CNRS (Institut des Sciences de l’Univers) et le CNES qui a pour vocation de fédérer et coordonner les actions des Services Nationaux d’Observations et de faire émerger des nouveaux services sur la thématique des surfaces planétaires. L’objectif du pôle est de mettre à disposition les données des missions spatiales et au sol, ainsi que de proposer des services de calculs sur ces données. Le pôle s’inscrit dans deux grandes familles de standards internationaux issues des Geosciences avec l’Open Geospatial Consortium (OGC), et de l’Astronomie International Virtual Observatory Alliance (IVOA).

14h-15h, Nicolas Darcel, Sciences Transformatives en Alimentation : Co-construction de Savoirs pour Améliorer la Qualité de l’Alimentation des Enfants – le projet « SPÉCIALE », (Français)

Vendredi 8 novembre (Biologie, Santé, Médicaments)
10h -11h, Nicolas Boulant, Projet Iseult et partage des données de santé

Edouard Duchesnay, Intelligence Artificielle, Neuroimagerie appliquée à la psychiatrie : l’enjeu de l’accès aux données (Français)

NeuroSpin au CEA de Saclay s’intéresse à l’exploration du cerveau sain et pathologique. Ici, nous pourrons présenter 2 volets de recherche couvrant le phénotypage de masse, multi-centrique, avec acquisitions standardisées et celui de pointe, moins répandu, rendu possible grâce à l’unique IRM Iseult.

11h30-13h, table ronde en visio (Français) : « L’évaluation et la science ouverte », animé par Patrick Couvreur

Liste des participants : Nicolas Gigant, Sofia Cussotto, etc. (à venir)

Des questions seront abordées :

Comment réaliser une évaluation objective et de qualité dans le contexte de la science ouverte ?
Faut-il proscrire absolument les données bibliométriques dans l’évaluation des chercheurs et des équipes ?
Le chercheur doit-il rester maître du choix de la revue dans laquelle il publie ? Liberté académique ?
Comment bien choisir la revue dans laquelle publier ?
Le chercheur doit-il conserver les droits d’auteur ? Ou bien ces droits relèvent-ils de l’institution dont il dépend ?
Comment homogénéiser les critères d’évaluation au niveau international ?
En plus des publications ne faut-il pas prendre en compte d’autres critères ? Lesquels ? Etc.
14h-15h, Grégoire Rey, France Cohortes, une infrastructure facilitant la production et le partage des données en épidémiologie (Français)

France Cohortes est une infrastructure de recherche dédiée aux grandes enquêtes en épidémiologie, et qui vise à faciliter la production, la gestion et le partage des données, en respectant la réglementation, la protection des données, et les principes FAIR.

15h30 – 16h30, Céline HERNANDEZ, FAIR_bioinfo : appliquer les principes FAIR dans un projet de bioinformatique (Français)

Les concepts FAIR (Facile à trouver, Accessible, Interopérable, Réutilisable) ont été initialement définis dans le contexte de l’ouverture des données de la recherche. Mais ces principes peuvent aussi être adaptés dans une certaine mesure à un projet de développement et/ou analyse bioinformatique/biostatistique. Dans ce cadre, des outils existants de suivi de version, d’aide à la reproductibilité ou encore de conteneurisation sont d’une grande aide. Avec cette idée, la formation FAIR_bioinfo a été mise en place à l’échelle nationale par l’Institut Français de Bioinformatique en partenariat avec l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, afin de propager la connaissance de ces outils et les bonnes pratiques associées.

Inscription et contact sur : https://osw2024.sciencesconf.org/